化学性质基本上是由核外电子层决定。
化学性质是否相同，决定于组成物质分子的官能团、酸根等分子或者离子或者原子团的组成，和分子构成无关。
（1）构成物质的每一个分子与该物质的化学性质是一致的，分子只能保持物质的化学性质，不保持物质的物理性质。
（2）“最小”不是绝对意义上的最小，而是保持物质化学性质的'最小。
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分子的性质
（1）分子质量和体积都很小。
（2）分子总是在不断运动着的。温度升高，分子运动速度加快。
（3）分子之间有间隔。一般说来，气体分子间隔距离较大，液体和固体的分子之间的距离较小。
（4）同种物质的分子性质相同，不同种物质的分子性质不同。
原子的化学性质相似由最外层电子数决定。
最外层电子数少于(或等于)3个，如碱金属、碱土金属元素，容易失去最外层电子，达到最外层8个电子的稳定结构，使得它有很强金属性与还原性。但是这对副族元素不适用，如金，银最外层都是1个电子，汞最外层则是2个电子，但是都很不活泼 。
最外层电子数多于(或等于)5个，如卤族、氧族元素，容易得到电子达到最外层8个电子的稳定结构，使得它有很强非金属性与氧化性。
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在一个原子中，电子和质子因为电磁力而相互吸引，也正是这个力将电子束缚在一个环绕着原子核的静电位势阱中，要从这个势阱中逃逸则需要外部的能量。电子离原子核越近，吸引力则越大。因此，与外层电子相比，离核近的电子需要更多能量才能够逃逸。
原子轨道则是一个描述了电子在核内的概率分布的数学方程。在实际中，只有一组离散的（或量子化的）轨道存在，其他可能的形式会很快的坍塌成一个更稳定的形式。这些轨道可以有一个或多个的环或节点，并且它们的大小，形状和空间方向都有不同。
每一个原子轨道都对应一个电子的.能级。电子可以通过吸收一个带有足够能量的光子而跃迁到一个更高的能级。
同样的，通过自发辐射，在高能级态的电子也可以跃迁回一个低能级态，释放出光子。这些典型的能量，也就是不同量子态之间的能量差，可以用来解释原子谱线。
化学性质与化学变化是两个不同的概念，性质是物质的属性，是变化的内因，性质决定变化；而变化是性质的具体表现，在化学变化中才能显出化学性质来。例如，酒精具有可燃性，所以点燃酒精，就能发生酒精燃烧的化学变化；而酒精的可燃性（化学性质）是通过无数次酒精燃烧现象得出的结论。
决定元素种类的是原子结构中的质子数。元素是具有相同核电荷数的一类原子的总称，不同种元素之间的`本质区别是质子数不同，所以元素的种类由质子数决定，具有相等质子数、不同中子数的是同种物质元素的同位素。
元素的分类及性质
元素分为金属元素、非金属元素和稀有气体元素，金属元素具有金属性，也就是说金属原子容易失电子；非金属元素具有非金属性，也就是废金属原子容易得电子。在反应中非金属单质通常具氧化性，可与H2形成气态氢化物，其最高价氧化物的水合物显酸性；金属单质具有还原性，可与水或酸反应生成H2，其氧化物的水化物显碱性。
元素的化学性质由什么决定
根据核外电子在化学反应中的作用，同种元素最本质的区别是质子数不同，最外层电子数决定元素的化学性质。所以决定物质的化学性质的最主要因素是构成物质的原子的最外层电子数。
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